Добро пожаловать на наш сайт!

Две модели были предложены для объяснения действия активаторов. В соответствии с первой из них активатор вступает в непосредственный контакт с РНК-П. Вторая модель предполагает отсутствие непосредственного контакта с РНК-П; по этой модели активатор изменяет конформации промоторной ДНК, облегчая инициацию транскрипции. Вторая модель довольно часто привлекалась для объяснения

- 4 -

механизма действия БАК, но в настоящее время большинство фактов свидетельствует в пользу первой модели даже для этого белка.

В соответствии с местом контакта активатора с РНК-П активаторы можно подразделить на следующие группы (Рис. 1.1.)

Контактирующие с карбокси-концом а-субъединицы РНК-П (аСт)

Наиболее изученным представителем этого класса является БАК. Сайт связывания для этого белка располагается перед -35 последовательностью. Интересно, что сайты связывания активаторов этого класса располагаются на различных расстояниях от промотора. Это объясняется структурой аСТТЭ. Эта субъединица РНК-полимеразы состоит из двух доменов, соединенных между собой гибким линкером. 1М-концевой домен контактирует с другими субъединицами РНК-полимеразы и поэтому жестко зафиксирован, тогда как аСТТЭ достаточно подвижен и поэтому может контактировать с активаторами, удаленными на различное расстояние. Естественно, это возможно, только если активатор контактирует с ДНК с той же стороны, что и РНК-П. Поэтому БАК может активировать транскрипцию, связываясь с ДНК в области -61 (как у 1ас промотора), либо в позициях -71, -81, -91.

Какова же роль аСТТЭ в этих процессах? Эксперименты с замещением аминокислотных остатков показывают, что для активации необходима ДНК-связывающая поверхность, а также некоторые основания, необходимые для взаимодействия с конкретным активатором. Какова же роль такого взаимодействия? В экспериментах по замещению аСТТ карбокси-концевым доменом репрессора фага X (с1) было показано, что такая гибридная с1-а субъединица способна обеспечивать активацию промотора при взаимодействии с полноразмерным с1 на промоторе с сайтом связывания с с1. Поскольку структура с1 совершенно отлична от таковой аСТТ, это свидетельствует о том, что любой дополнительный контакт способен усиливать транскрипцию, не изменяя локальной структуры ДНК.